Hola:
Sobre las recetas, recomiendo que te leas la guía de instalación del día zero, los consejos de buenas practicas, y los whitepapers de seguridad y backups en los links que te he pasado.
Yo prefiero usar el instalador, me parece que es un buen punto de partida, sobre todo si no eres un experto en settings JVM, Tomcat o dependencias de terceros como Libreoffice. Date cuenta que la parametrización del instalador ya hace algunas cosas, como ciertos settings JVM especificos para SOLR o Alfresco, o la configuración de certificados SSL en Tomcat... Es una configuración de partida que proporciona Alfresco, con un stack de dependencias certificado (en el caso de la versión EE) o al menos "más testado" por la comunidad (en el caso de la CE). Y eso siempre tiene beneficios, por ejemplo, en la documentación que encuentres en la red, o errores reportados.
Y separar las capas siempre que es posible, es una recomendación esencial (cuando se puede - en la EE dependiendo de la licencia en el caso de SOLR). Un frontend como proxy inverso, la capa de aplicación (normalmente no separo Share del repositorio), SOLR (cuando puedo) y base de datos. Principalmente separar la bbdd, y SOLR en maquinas separadas.
Saludos.
--C.
