Bom dia.
Pelos 2 motivos e outros, como melhor sistema de gerenciamento de disco, melhor aproveitamento de recursos de hardware por não ter interface gráfica.
E também por questões de preferência pessoal.
Se você pesquisar, verá que a grande maioria dos que instalam o Alfresco em ambientes sérios de produção utilizam Linux.
Realmente a única razão para eu ainda utilizar Windows é quando o cliente tem restrições, por não querer usar Linux, que normalmente é por não conhecer ou não ter alguém que possa cuidar, ou então porque usam toda a infra da empresa baseada em soluções Microsoft.
