Acabo de probar en una 3.4.2 y funciona correctamente: Subo un doc, le aplico el aspecto versionable. Edito en linea el doc. Y a continuación me pone: Versión 1.0 y la actual 1.1
¿Podrías mirar si el alfresco.log de tu despliegue te lanza algun error? Porque como comentas ese error no es normal.
La verdad que esto es muy raro. Según parece soporte de Alfresco comenta que es un comportamiento que ha cambiado, a mi me parece muy raro la verdad ..