Vado a memoria, ma credo che in Tomcat Alfresco salvi i file in upload tramite la UploadFileServlet nella directory temp di Tomcat, e poi da questa siano copiati nel content store.
Questo errore arriva da una IOException tirata dalla JVM, significa che è fallita una operazione di basso livello sul file system. Non è quindi un errore a livello applicativo, è la JVM che non riesce a completare la write. Non hai altri stacktrace nel log? Su che sistema operativo sei?
Secondo me fallisce la creazione del file temporaneo di upload nella directory temp di tomcat, che nel tuo caso è: /usr/local/apache-tomcat-6.0.24/temp/
Il tuo content store (alf_data) è situato su un altro file system? Sei sicuro di avere abbastanza spazio libero nella directory temp menzionata? Prova a vedere che non sia siano accumulati troppi file li dentro e che quel file system non sia pieno.
Sto dando per scontato che alf_data stia su un altro file system con spazio più che sufficiente. Se così non fosse, potrebbe invece essere fallita la copia da temp di Tomcat ad alf_data, cosa bizzarra a meno di non avere un disco pieno o con problemi.
