Boa tarde.
O arquivo share-config-custom.xml "normalmente" está dentro da pasta <alfresco_install>/tomcat/shared/classes/alfresco/web-extension
Mas você também pode ter o mesmo arquivo no seu projeto, quando você usar o Alfresco SDK para gerar para você.
Já os demais arquivos, você pode ignorá-los por completo, pois eles já não são mais utilizados desde a versão, se não me engano, 4.0.x.
Esses são arquivos da antiga interface de usuário, chamada Alfresco Explorer.
