Buenas lexcor,
Respecto a tu primera pregunta, la unica forma que se me ocurre para aplicar metadatos nuevos a un contenido ya existente, es atraves de aspectos. Creas un aspecto nuevo con los metadatos que necesites y se lo aplicas a dichos documentos. Esto creo que deberia funcional porque es una de las utilidades del uso de aspectos.
Respecto a la segunda pregunta, creo que no se puede, almenos yo hice esa misma pregunta hace ya bastantes meses y me dijeron que no. No se si habran avanzado en esto. Hoy precisamente he estado en un evento de Alfresco y no se si con el nuevo Sharepoint conector (o algo asi) se podra hacer.
Saludos