Bom dia.
Por padrão, para o AD, o Alfresco usa esta configuração:
# The attribute on person objects in LDAP to map to the email property in Alfresco
ldap.synchronization.userEmailAttributeName=mail
Verifique se o seu servidor está usando o atributo mail, e por acaso for outro, simplesmente substitua o mail pelo atributo correto, coloque essa propriedade no arquivo alfresco-global.properties e reinicie o serviço.
Você terá que configurar o sincronismo para fazer o sincronismo full novamente, pois a consulta padrão só executa a atualização para registros modificados desde a última execução.