Hallo,
ich habe diese Konstellation eben versucht nachzustellen (allerdings mit Alfresco Version 4.1.5). Dort hat es wie gewünscht funktioniert. Dazu habe ich eine Ordnerregel erzeugt, die neue oder veränderte Dokumente in einen anderen Ordner kopiert. Beim verändern der Originaldatei werden dann automatisch neue Versionen der Zieldatei erstellt. Wird die Zieldatei zwischenzeitlich verändert, laufen die Versionsnummern natürlich auseinander (die Zieldatei hat dann eine entsprechend höhere Versionsnummer). Ansonsten ist die Versionsnummer identisch.
Möglicherweise handelt es sich um einen Bug in der verwendeten Alfresco Version (?).
Viele Grüße