Bonjour,
Je ne connais pas Websphere, mais je pense qu'il doit être possible de faire fonctionner les deux en même temps. Il suffit de faire attention à ce que les 2 applications n'écoutent pas sur les mêmes ports (généralement 8080 et 8009 pour tomcat), c'est de la configuration de tomcat et non d'alfresco.
Concernant l'installation d'alfresco avec Websphere, je ne vais pas pouvoir t'aider. Mais du moment que Websphere suit les standards et qu'il tourne avec une JVM 1.5, ça devrait aller.
Laurent