Ok j'ai parlé trop vite, j'ai résolu mon problème :
Pour ceux qui passerai :
Dans shared/classes/alfresco/web-extension
Fichier share-config-custom.xml, il y a trois endpoints a changer comme la préciser rguinot.
J'ai aussi changer le fichier alfresco-global.properties et indiqué les nouveaux ports
Merci !